La biotecnològica Sequentia Biotech, amb seu en el Parc Científic de Barcelona (PCB), ha desenvolupat la primera base de dades d'ARN no codificant en espècies vegetals: GreeNC. Es tracta d'un repositori de més de 200.000 lncRNAs anotats en 37 classes de plantes i 6 algues que proporciona informació sobre la seqüència, coordenades genòmiques, potencial de codificació i plegat d'energia per a tots els lncRNAs identificats.

Els lncRNAs (Long non-coding RNAs) són molècules d’ARN (àcid ribonucleic) no codificant –és a dir, que no originen proteïnes–, però que tenen un paper clau en la regulació de l’expressió dels gens i en importants processos de la biologia cel·lular: al genoma humà poden actuar, per exemple, com a oncògenes o gens supressores de tumors, en funció de la via en la qual participen, o si regulen positivament o negativament.

Quant a les plantes, malgrat ser un àrea de recerca fins ara molt poc explorada, estudis validats experimentalment han demostrat que els lncRNAs regulen importants característiques agronòmiques, com ara la resposta a la carència de fosfat, el temps de floració i la interacció amb organismes simbiòtics, fent-los de gran interès en la biologia i cria de la planta.

“El nostre objectiu és oferir a tota la comunitat científica una innovadora eina de predicció bioinformática i repositori de lncRNAs de plantes que pugui donar un impuls a la recerca d’aquestes importants molècules. Gràcies a GreeNC els investigadors de tot el món tenen l’oportunitat d’accedir fàcilment a tota la informació sobre els lncRNAs de plantes i compartir els seus resultats”, explica Riccardo Aiese Cigliano, cofundador de Sequentia.

Reduir la bretxa entre les dades genòmics i la seva interpretació

Sequentia centra la seva activitat en el sector de la bioinformàtica, la genòmica aplicada i la biotecnologia verda. Fundada per dos joves investigadors italians, Riccardo Aiese Cigliano i Walter Sanseverino, la seva missió és crear know-how propi amb l’objectiu de millorar l’accessibilitat a la informació produïda per les tecnologies de seqüenciació de nova generació (Next Generation Sequencing, NGS) per aconseguir un desenvolupament sostenible que ajudi a la millora de la qualitat dels aliments, la conservació del medi ambient i la salut humana.

L’empresa diversifica la seva activitat en diversos departaments: SequentiaGreen, (biotecnologia, bioinformàtica i genòmica aplicada al sector vegetal), SequentiaHealth (estudi del genoma humà amb finalitats clíniques i diagnòstiques), SequentiaResearch (R+D en noves tecnologies, participació en recerques internacionals i treballs científics) i SequentiaTraining (activitats de formació i divulgació científica).

“La nostra última finalitat consisteix a crear innovació en l’àmbit genòmic i de la biotecnologia verda amb la finalitat de millorar els cultius, reduir els preus i augmentar la disponibilitat de tractaments farmacèutics contra diferents malalties als països més necessitats. Estem convençuts que aquests dos sectors constitueixen un recurs estratègic i sostenible per a la protecció del medi ambient, la preservació de la biodiversitat i el benestar de la humanitat i del planeta”, afirma Walter Severino, cofundador i CEO de Sequentia.

Gràcies al seu departament SequentiaResearch, aquests mes de gener la companyia ha estat entre les 5 finalistes espanyoles del concurs internacional de emprendedoria social ‘The Venture’ amb el seu projecte Artepharming, co-finançat pel Ministeri de Economia i Competitivitat, que apunta a investigar el desenvolupament de biotecnologies a partir de la planta d’Artemisia annua que  té efectes positius en la lluita contra la malària, com ho ha demostrat la guanyadora del Nobel de Medicina el 2015, la investigadora xinesa Youyou Tu. 

Un ‘know-how’ validat per prestigioses publicacions científiques

Sequentia és una de les empreses de referència en l’àmbit de la genòmica aplicada a la biotecnologia verda. Els seus pipelines bioinformàtics s’han utilitzat en nombrosos treballs de recerca en el camp de l’agricultura biofarmacèutica (biopharming), i els seus cofundadors han publicat importants estudis en revistes científiques de la talla de Nature, PNAS i EMBO.  

La seqüenciació d’una soca no tòxica del fong Aspergillus carbonarius, publicada en Nature Reports (doi:10.1038/srep09086); la seqüenciació del genoma d’una varietat de patata, Solanum commersonii, publicada en Plant Cell com a article de portada (doi: 10.1105/tpc.114.135954); o la primera anàlisi exhaustiva de la diversitat genètica del meló, publicada en Molecular Biology and Evolution (doi: 10.1093/molbev/msv152), són tres de les set publicacions científiques en què han participat Riccardo Aiese Cigliano i Walter Sanseverino de Sequentia només l’any passat.

Sanseverino també va formar part de l’equip d’investigadors que va seqüenciar el 2012 el genoma del meló. Va ser la primera vegada que un consorci publicoprivado de l’Estat espanyol va aconseguir un genoma complet d’una espècie superior de plantes (amb flor i fruits) i a més, mitjançant noves tecnologies de seqüenciació massiva. El treball (doi: 10.1073/pnas.1205415109) es va publicar Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).