L’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona), amb seu al PCB, és un dels 14 centres de recerca i hospitals de la Unió Europea que participaran, durant el propers 5 anys, en el projecte internacional DECIDER, que arrenca amb un finançament de 15 M€ de la Comissió Europea amb l’objectiu de millorar les teràpies personalitzades per al càncer d’ovari. El laboratori de Genome Data Science, dirigit per Fran Supek, analitzarà l’evolució de cada tumor concret per desenvolupar models computacionals que permetin fer recomanacions de tractament basades en el perfil genètic.

A Europa, més de 40.000 dones moren de càncer d’ovari cada any. A més de la cirurgia, la majoria de les pacients són tractades amb quimioteràpia a base de platí. Per desgràcia, l’efecte de la quimioteràpia sol disminuir amb els cicles de tractament, i actualment es disposa de pocs tractaments eficaços per a les pacients que desenvolupen resistència als fàrmacs basats en el platí.

El projecte DECIDER (“Improved clinical decisions via integrating multiple data levels to overcome chemotherapy resistance in high-grade serous ovarian cancer”), que arrenca aquest mes de febrer, desenvoluparà eines de diagnòstic per identificar de forma més primerenca i fiable a les pacients que no responen als tractaments actuals. A partir de les dades obtingudes dels tumors, el projecte també té per objectiu descobrir tractaments combinats eficaços.

“El que fa únic a aquest projecte, a més de la multidisciplinarietat i l’extraordinària qualitat dels socis, és que treballarem amb diverses mostres dels mateixos tumors, obtingudes en diferents moments. Estudiarem l’evolució de l’tumor, i el nostre principal objectiu és poder anticipar els canvis genètics en el càncer que condueixen a la resistència al tractament”, explica Fran Supek, investigador ICREA i cap del laboratori de Genome Data Science de l’IRB Barcelona.

Fran Supek (Foto: IRB Barcelona).

Intel·ligència artificial per integrar i visualitzar la informació de pacients per als metges

Al laboratori de Supek, els investigadors treballaran en el desenvolupament de models computacionals capaços de predir l’evolució un tumor d’ovari en concret amb la finalitat de fer recomanacions de tractament eficaços i personalitzats basades en el perfil genètic. El grup combinarà enfocaments experimentals, basats en l’edició genètica, i enfocaments computacionals, basats en machine learning, per comprendre els mecanismes de resistència als fàrmacs i a la radiació.

“Els tumors acostumen a tenir mecanismes defectuosos per reparar el seu ADN, la qual cosa n’accelera l’evolució, però també pot donar lloc a vulnerabilitats o resistències als fàrmacs. Si comprenem els mecanismes subjacents a la resistència, al seqüenciar el tumor, podríem predir si és fàcil que guanyi resistència a un fàrmac específic en el futur. Això ens portaria a comprendre quins altres tractaments serien més eficaços en aquest tumor concret, per frenar la seva evolució i, en última instància, millorar els resultats mèdics “, explica Supek.

Una part important del projecte serà la col·laboració amb petites i mitjanes empreses (PIMES) en el desenvolupament, la producció i el registre de kits de diagnòstic, l’elaboració d’una prova de sensibilitat als fàrmacs basada en les mostres tumorals, el desenvolupament de diagnòstics basats en imatges de mostres digitals i el desenvolupament de tècniques d’anonimització de dades, necessàries per a la gestió de dades sensibles de pacients per a la protecció de la privacitat. Les organitzacions de pacients tenen un important paper d’assessorament en el projecte.

A més de la recerca mèdica, el projecte també inclou un paquet de treball jurídic que n’aborda els aspectes ètics i legals. A més, els investigadors jurídics també estudiaran si hi ha incoherències entre el sistema de regulació farmacèutica i altres legislacions pertinents.

» Més informació: web de l’IRB Barcelona [+]