L'equip liderat per David Rossell i Patrick Aloy de l'IRB Barcelona –amb seu al Parc Científic de Barcelona– i l'empresa Anaxomics Biotech ha aconseguit la quarta posició mundial en una competició per pronosticar i classificar pacients en un "test a cegues" per a quatre patologies. La competició –en què han participat 54 equips, procedents majoritàriament d'Europa i els Estats Units– es va plantejar en el marc del projecte IMPROVER (acrònim d'Industrial Methodology for PROcess VErification in Research), una iniciativa promoguda per IBM Research i Philip Morris International amb l'objectiu de desafiar als millors investigadors biocomputacionals d'arreu del món a demostrar la funcionalitat dels seus mètodes per explotar la informació genòmica amb finalitats predictives i clíniques, amb resultats fiables i verificables.

”

Les biociències estan generant una quantitat ingent de dades a una velocitat sense precedents per la qual cosa donar valor i extraure informació útil i fiable de les bases de dades és cada vegada més difícil i complex. El primer repte d’IMPROVER ha posat de relleu la capacitat predictiva de la biocomputació donat que la immensa majoria de participants ha pogut diagnosticar als pacients amb una certesa propera al 90%, i en alguns casos al 100%.

Concretament, el primer repte plantejat per IMPROVER (acrònim d’ Industrial Methodology for PROcess VErification in Research) anomenat “Diagnosis Signature consistia en avaluar i verificar, amb aproximacions computacionals, mostres de pacients amb psoriasis, esclerosi múltiple, obstrucció pulmonar crònica i càncer de pulmó, explotant dades genòmiques de mostres clíniques, mitjançant el que s’anomena un ‘test a cegues’.

Segons David Rossell, cap de la Plataforma de Bioestadística i Bioinformàtica de l’IRB Barcelona i dissenyador dels algoritmes probabilístics de predicció, “aquests reptes internacionals són molt eficaços com a prova de concepte, és a dir, per demostrar que és possible predir i que pot fer-se bé, tota vegada que s’exposen al món les tècniques més avançades i eficaces per aconseguir-ho”.

A més, en paraules de Patrick Aloy, cap de grup en el programa conjunt IRB Barcelona-BSC de biologia computacional, especialitzat en caracteritzar xarxes moleculars per a diferents patologies, “la competició afavoreix la creació d’un cos d’evidència científica fort davant la comunitat biomèdica, tant d’investigadors com de metges, el que dóna valor i aporta confiança cap a les tècniques biocomputacionals i les seves possibles aplicacions industrials”.

Enllaç a la notícia [+]