Gaia, el primer programari ‘cloud’ intuïtiu que ofereix metagenòmica comparativa humana, animal i vegetal en temps real Notícies

Sequentia Biotech, amb seu al Parc Científic de Barcelona (PCB), ha desenvolupat Gaia un programari cloud capaç de gestionar i analitzar dades metagenòmiques de qualsevol comunitat microbiana (bacteris, virus i eucariotes) generats per les tecnologies de nova seqüenciació (Next Generation Sequencing, NGS) aplicades a la genètica humana, animal i vegetal.  Es tracta de la primera eina bioinformàtica que integra automàticament tots els nivells de la classificació taxonòmica amb la funcional (des del regne fins a la subespècie) en tan sols 12 hores i permet comparar les mostres en temps real. Gaia és una plataforma cloud computing que es distribueix en la modalitat SaaS (‘Programari as a Service’) – basada en la facturació pel consum– i és molt intuïtiva; qualsevol investigador que no sigui expert en bioinformàtica la pot utilitzar.

 

Desxifrat el genoma de l’olivera, l’arbre més emblemàtic de la Mediterrània Notícies

Un equip d’investigadors del Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica CNAG-CRG) –amb seu al Parc Científic de Barcelona–, del Centre de Regulació Genòmica (CRG) i del Real Jardí Botànic a Madrid (CSIC-RJB) aporta nova llum sobre el puzle genètic de l’olivera en aconseguir seqüenciar per primera vegada el genoma complet d’aquesta espècie. Els resultats es publiquen aquesta setmana a la revista d’accés obert GigaScience i obren la porta a poder contribuir a la millora genètica de la producció d’olives i d’oli, de gran rellevància en l’economia i la dieta espanyoles.

 

Neix GreeNC, la primera base de dades d’ARNs no codificants en plantes Notícies

La biotecnològica Sequentia Biotech, amb seu en el Parc Científic de Barcelona (PCB), ha desenvolupat la primera base de dades d’ARN no codificant en espècies vegetals: GreeNC. Es tracta d’un repositori de més de 200.000 lncRNAs anotats en 37 classes de plantes i 6 algues que proporciona informació sobre la seqüència, coordenades genòmiques, potencial de codificació i plegat d’energia per a tots els lncRNAs identificats.

 

L’IRB Barcelona crea un mètode avançat i la primera plataforma de simulacions d’ADN Notícies

El Laboratori de Modelització Molecular i Bioinformàtica de l’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona), liderat per Modesto Orozco, publica avui a Nature Methods un nou mètode que permet simular la dinàmica de l’ADN a nivell atòmic amb una exactitud mai abans aconseguida.Totes les simulacions i la seva anàlisi estan allotjats a la primera plataforma de simulacions atomístiques d’àcids nucleics desenvolupada fins ara, la qual és lliure i accessible a tota la comunitat científica dins de la infraestructura de l’Institut Nacional de Bioinformàtica i la xarxa europea ELIXIR-Excellerate.

 

Un gran pas endavant cap a la comprensió de les propietats elèctriques de la cèl·lula Notícies

Un equip de l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) al PCB, que l’any passat va aconseguir mesurar, per primer cop la polarització elèctrica del DNA –una propietat fonamental vinculada a les funcions biològiques– ha fet un avanç encara més gran cap a la comprensió de les propietats dielèctriques dels constituents cel·lulars. Els investigadors han aconseguit mesurar la polarització elèctrica dels principals components de la membrana cel·lular –lípids, esterols i proteïnes– amb una resolució espacial menor de 50nm.  El resultats d’aquest treball –publicat a la revista Nanoescala– són claus per desenvolupar nous mètodes que responguin a la pregunta fonamental de com les membranes cel·lulars s’organitzen a la petita escala.

 

Investigadors de l’IBUB i dels CCiTUB participen en la síntesi d’unes molècules que actuen contra el virus de la grip A Notícies

Investigadors de la Facultat de Farmàcia de la Universitat de Barcelona (UB), de l’Institut de Biomedicina de la UB (IBUB) i dels Centres Científics i Tecnològics de la UB (CCiTUB) –tots dos ubicats al Parc Científic de Barcelona– han sintetitzat unes molècules capaces de bloquejar el virus que provoca la grip A i també algunes de les mutacions que el fan resistent als fàrmacs més habituals. A l’estudi –publicat al Journal of Medicinal Chemistry (doi: 10.1021/jm5005804), revista de la Societat Americana de Química (ACS)– hi han participat el grup del professor Santiago Vázquez, del Laboratori de Química Farmacèutica, i el grup del professor F. Javier Luque, del Departament de Fisicoquímica.