Skip to main content
< Tornar a notícies
Imatge: IRB Barcelona.
 04.06.2020

Investigadors de l’IRB Barcelona desenvolupen una eina de lliure accés per accelerar el descobriment de fàrmacs

Investigadors de l'Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) al PCB, liderats per l'investigador ICREA Patrick Aloy, han desenvolupat el Chemical Checker, una eina online de lliure accés que proporciona informació processada i harmonitzada de la bioactivitat d'1 milió de molècules petites en una àmplia gamma d'entorns biològics.

 

Conèixer com interactua una molècula amb l’organisme és crucial a l’hora de considerar el seu potencial terapèutic. Liderat per l’investigador ICREA Patrick Aloy, el laboratori de Bioinformàtica Estructural i Biologia de Xarxes (SBNB) de l’IRB Barcelona ha presentat el Chemical Checker, una eina online de lliure accés que proporciona informació sobre els efectes de més d’1 milió de compostos en una àmplia gamma d’entorns biològics.

El Chemical Checker, publicat a Nature Biotechnology, ofereix un ampli ventall de dades de molècules petites, que van més enllà de la informació química, oferint noves perspectives per explorar el seu potencial terapèutic.

El laboratori de SBNB ja ha demostrat el potencial de l’eina en aconseguir revertir alteracions genètiques pròpies de l’Alzheimer in vitro, utilitzant medicaments ja aprovats i compostos experimentals. Aquest grup de científics també ha identificat diversos compostos que podrien substituir els tractaments per “biològics”, com ara les teràpies amb anticossos, que mostren una alta especificitat i eficiència, però són costosos i propensos a problemes farmacocinètics.

“Preveiem moltes aplicacions per al Chemical Checker en el procés de descobriment de fàrmacs”, explica Aloy, “com, per exemple, consultes per prioritzar el reposicionament de fàrmacs i les oportunitats de la combinació, basades en els trets de bioactivitat desitjats”.

El Chemical Checker ja ha donat lloc a una col·laboració amb Amazon per generar una base de dades de lliure accés per posar a l’abast d’investigadors de tot el món una cartera ampliada de molècules amb el potencial de combatre la COVID-19. L’experiència d’Amazon en text mining, machine learning i comprensió del llenguatge natural ha permès incorporar l’anàlisi automàtica d’articles científics al Chemical Checker. La plataforma COVID-19 està disponible en https://sbnb.irbbarcelona.org/covid19/.

► Article de referència: Miquel Duran-Frigola, Eduardo Pauls, Oriol Guitart-Pla, Martino Bertoni, Víctor Alcalde, David Amat, Teresa Juan-Blanco & Patrick Aloy. “Extending the small-molecule similarity principle to all levels of biology with the Chemical Checker“. Nature Biotechnology (2020) DOI:10.1038/s41587-020-0502-7

► Més informació: web de l’IRB Barcelona [+]