Investigadores de la Universidad de Barcelona (UB), el Instituto de Biomedicina de la UB (IBUB) –ubicado en el PCB– y el Centro de Regulación Genómica (CRG) forman parte de un consorcio internacional de expertos que ha publicado una valoración sistemática y a gran escala del software que se utiliza para analizar la expresión de los genes a partir de datos de la metodología de secuenciación del ARN. Los resultados, publicados ahora por la revista Nature Methods (doi:10.1038/nmeth.2714), podrían inspirar nuevas aproximaciones computacionales para gestionar las tecnologías actuales y futuras que permiten caracterizar la estructura de los genes y estudiar su expresión.

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En el estudio han participado los investigadores Josep F. Abril, del Departamento de Genética de la UB y miembro del IBUB, y Roderic Guigó, del CRG, que también fueron los únicos participantes de todo el Estado en el proyecto Genoma Humano, uno de los grandes hitos científicos en el ámbito de la genética humana.

Tal como explica el investigador del IBUB Josep F. Abril «el artículo es fruto de un proyecto para evaluar la fiabilidad de los programas de predicción de genes más modernos, en el contexto de las evidencias provenientes de datos de secuenciación del ARN (ultrasecuenciación de transcriptomas) y de cómo estos datos pueden mejorar la anotación de los genes y los modelos computacionales que los definen».

«Comparando de forma sistemática las herramientas computacionales existentes para la detección de genes sobre los genomas, intentamos determinar si los nuevos datos de secuenciación del ARN mejoran o no la fiabilidad de las estructuras génicas predichas», apunta el profesor Abril, investigador principal del Laboratorio de Genómica Computacional de la UB. «Además de obtener nuevas herramientas para la predicción —continúa el experto—, también hemos podido identificar las cuestiones que habrá que corregir en el futuro y conocer en qué puntos tenemos que seguir investigando para mejorar estas herramientas».

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