Descifran los primeros epigenomas de la Leucemia Linfática Crónica
Un estudio, publicado hoy en la revista Nature, ofrece una nueva perspectiva en la investigación del cáncer, al integrar los resultados de la secuenciación completa del epigenoma y del genoma en pacientes afectados de Leucemia Linfática Crónica (LCC). La investigación ha revelado más de un millón de alteraciones epigenéticas–un hallazgo inesperado que indica una reprogramación masiva del epigenoma de las células cancerosas– y ha evidenciado también que la mayoría de estas alteraciones tienen lugar en regiones del genoma que anteriormente no se habían estudiado. Los resultados del trabajo –en el que han participado científicos del Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG) y del Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona), ubicados en el Parc Científic de Barcelona– aportan datos claves para identificar las células que originan la enfermedad, descubren nuevos mecanismos moleculares implicados en su desarrollo y ofrecen una nueva aproximación para mejorar el diagnóstico.
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La investigación se enmarca dentro del Consorcio Español para el Estudio del Genoma de la Leucemia Linfática Crónica, que ha contado con la participación de investigadores del Consorcio Europeo BLUEPRINT para el estudio del epigenoma. Durante los últimos dos años, este consorcio —que se integra a su vez dentro del Consorcio Internacional de los Genomas del Cáncer— ha publicado dos destacados trabajos en las revistas Nature y Nature Genetics que han permitido caracterizar el mapa genético de las mutaciones asociadas a la enfermedad.
El trabajo ha sido presentado hoy por sus coordinadores, Elías Campo, de la Facultad de Medicina de la UB y del Hospital Clínic, Carlos López-Otín, de la Universidad de Oviedo, junto al director de la investigación, Iñaki Martín-Subero, de la Facultad de Medicina de la UB y del Instituto de Investigaciones Biomédicas August Pi i Sunyer (IDIBAPS). El acto ha estado presidido por la secretaria de Estado de Investigación, Desarrollo e Innovación del Ministerio de Economía y Competitividad, Carmen Vela, y ha contado también con la presencia del director del Instituto de Salud Carlos III, Joaquín Arenas.
La secretaria de Estado de I+D+i ha subrayado la «importancia de este estudio» y ha afirmado que trabajos como este «evidencian la calidad de nuestra ciencia y de nuestros investigadores. Todo avance en este campo es importante, y si lo lideran científicos españoles además de importante es muy gratificante. España hace ciencia de calidad y estamos trabajando para que así siga siendo en el futuro».
Elías Campo ha recordado que los estudios previos del Consorcio se habían centrado en el análisis de las mutaciones del genoma implicadas en la LLC. «En este estudio —ha añadido— hemos ampliado nuestra perspectiva al estudio del epigenoma, lo cual nos ha permitido identificar las células que originan la leucemia y nuevos mecanismos que participan en su desarrollo».
«Si en los estudios genéticos anteriores pudimos identificar más de 1.000 genes mutados en la leucemia linfática crónica, el estudio del epigenoma ha revelado más de un millón de alteraciones epigenéticas en esta enfermedad. Se trata de un hallazgo inesperado e indica que el epigenoma de las células sufre una reprogramación masiva en el proceso de desarrollo del cáncer», ha explicado López-Otín.
La contribución del CNAG
Las nuevas técnicas de secuenciación masiva del Centro Nacional de Análisis Genómico, así como la utilización de micromatrius (microarrays) de alta densidad han permitido la caracterización de la epigenoma de la leucemia en un tiempo relativamente corto. El análisis del gran volumen de datos generados en este proyecto ha requerido la creación de nuevos métodos, que han sido desarrollados por los grupos de bioinformàtica del CNAG, junto con el equipo del Dr. Martin-Subero, con el fin de revelar los patrones epigenéticos para la clasificación de pacientes con Leucemia Linfática Crónica en tres grupos con diferente evolución clínica.
Según Ivo Gut: «Este proyecto deja patente la importancia de los análisis epigenómicos de alta resolución en la Leucemia Linfática Crónica. Hemos logrado un conocimiento mucho más profundo de esta enfermedad, lo que tendrá muchos beneficios, sin duda, para los pacientes que la sufren».
«Hasta la fecha, la mayoría de los estudios de epigenética se centraban en el análisis de una pequeña fracción del genoma que se consideraba relevante para la expresión de los genes. Nuestros hallazgos demuestran claramente que la mayoría de las alteraciones epigenéticas tienen lugar en regiones del genoma que anteriormente no se habían estudiado», ha remarcado el Dr. Martín-Subero.
