Skip to main content
< Tornar a notícies
D'esquerra a dreta, els investigadors Roberto Mosca i Patrick Aloy, principals autors del treball publicat avui a Nature Methods. Foto: IRB Barcelona.
 27.02.2015

Una eina computacional desenvolupada a l’IRB Barcelona s’incorpora al consorci mundial Pan-Cancer d’anàlisi de tumors humans

El laboratori dirigit per l'investigador ICREA Patrick Aloy, de l'Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) –amb seu al Parc Científic de Barcelona– presenta avui a Nature Methods (doi:10.1038/nmeth.3289) una eina computacional que permet avançar en la comprensió de les causes genètiques de malalties complexes com ara el càncer, l'Alzheimer o la diabetis. 

Els investigadors del Laboratori de Bioinformàtica Estructural i Biologia de Xarxes han introduït en una plataforma web oberta les més de 23.000 mutacions genètiques documentades a dia d’avui que afecten la funció de 2.000 proteïnes, i han col·locat aquestes proteïnes mutades sobre el mapa d’interaccions conegudes entre proteïnes humanes.

Desenvolupada íntegrament a l’IRB Barcelona, dSysMap -nom en anglès per a “mapa sistèmic de malalties”- ofereix detalls moleculars de com les mutacions en determinades proteïnes alteren les relacions amb d’altres proteïnes, el que genera un efecte en el correcte funcionament dels processos cel·lulars.

Utilitat i nou coneixement

L’eina ha permès explicar, per exemple, per què mutacions en una mateixa proteïna poden provocar dues malalties diferents o per què mutacions localitzades en proteïnes diferents poden desencadenar una mateixa patologia.dSysMap integra informació per a 2.804 malalties complexes.

“Col·loquem les mutacions en un context global de processos biològics, en el que anomenem biologia de sistemes o biologia de xarxes; i fent això oferim una visió més completa dels efectes de les mutacions patològiques conegudes”, diu Patrick Aloy. I descriu dSysMap com “un generador d’hipòtesis que a més aporta detalls mecanístics moleculars per poder entendre millor malalties complexes de base genètica, que són la majoria, com càncer, Alzheimer o diabetis”.

dSysMap és accessible de franc a http://dsysmap.irbbarcelona.org i els científics d’arreu del món hi poden incorporar les seves dades de forma totalment anònima.

L’equip ha dut a terme aquest projecte amb fons europeus provinents del 7è programa marc i del Consell Europeu de Recerca a través d’un projecte ERC Consolidator Grant atorgat a Aloy.