{"id":89336,"date":"2023-10-19T11:29:33","date_gmt":"2023-10-19T09:29:33","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/un-equipo-cientifico-del-cnag-y-el-imedea-descifra-el-primer-genoma-a-escala-cromosomica-del-raor\/"},"modified":"2023-10-26T17:21:04","modified_gmt":"2023-10-26T15:21:04","slug":"un-equipo-cientifico-del-cnag-y-el-imedea-descifra-el-primer-genoma-a-escala-cromosomica-del-raor","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/es\/un-equipo-cientifico-del-cnag-y-el-imedea-descifra-el-primer-genoma-a-escala-cromosomica-del-raor\/","title":{"rendered":"Un equipo cient\u00edfico del CNAG y el IMEDEA descifra el primer genoma a escala cromos\u00f3mica del raor"},"content":{"rendered":"

Un equip del Centro Nacional de An\u00e1lisis Gen\u00f3mico (CNAG)<\/a>, con sede en el Parque Cient\u00edfico de Barcelona, y del Instituto Mediterr\u00e1neo de Estudios Avanzados, IMEDEA (CSIC-UIB)<\/a>, ha conseguido descifrar las piezas que conforman el c\u00f3digo gen\u00e9tico del raor. Un proyecto de gran impacto para la biodiversidad del territorio y\u00a0 la conservaci\u00f3n de esta especie marina, que ha contado con la financiaci\u00f3n de la Iniciativa Catalana para el Earth Biogenome Project<\/a>, a trav\u00e9s del Instituto de Estudios Catalanes. La investigaci\u00f3n, que ha permitido obtener el primer genoma a nivel cromos\u00f3mico de esta especie, supone un enorme paso adelante para entender el papel de la biolog\u00eda molecular en la conservaci\u00f3n de los recursos pesqueros.<\/strong><\/p>\n

El\u00a0Xyrichtys novacula, llorito o raor, como se conoce m\u00e1s popularmente, es un pez que se ha convertido en todo un icono medi\u00e1tico, sobre todo por la tradici\u00f3n pesquera en las Islas Baleares y su alto valor culinario.<\/p>\n

Menos conocidas son sus particularidades comportamentales y gen\u00e9ticas. Al igual que los humanos, los raors incorporan a su comportamiento cronotipos, es decir, preferencias individuales por los horarios en los que realizan sus actividades diarias, hecho que hace que haya raors activos a una hora m\u00e1s temprana que otros.<\/p>\n

Se ha observado que tienen ciertos comportamientos sociales, donde los machos m\u00e1s agresivos defienden en\u00e9rgicamente grandes parcelas de fondo arenoso, que incluyen los territorios m\u00e1s peque\u00f1os de las hembras de su har\u00e9n. Estas peculiaridades comportamentales est\u00e1n codificadas gen\u00e9ticamente tanto en humanos como en el resto de animales.<\/p>\n

En una especie explotada por la pesca como el raor, el hecho que determinados comportamientos tengan una base gen\u00e9tica, puede resultar en la eliminaci\u00f3n de ciertas variantes gen\u00e9ticas en las poblaciones naturales que pueden comprometer su futuro.<\/p>\n

Las poblaciones con poca diversidad gen\u00e9tica tienen menos resiliencia y es en este punto donde entran en juego los estudios gen\u00e9ticos para garantizar el futuro del raor. Josep Al\u00f3s, uno de los cient\u00edficos del IMEDEA que lidera esta investigaci\u00f3n, explica: \u201cConocer mejor qu\u00e9 caracter\u00edsticas comportamentales y gen\u00e9ticas afectan la vulnerabilidad a la pesca, puede ser muy \u00fatil para dise\u00f1ar medidas en el \u00e1mbito de la conservaci\u00f3n y asegurar el futuro de esta especie. Desgraciadamente el c\u00f3digo gen\u00e9tico del raor no estaba disponible para evaluarlas\u201d.<\/p>\n

\"\"

Raor. \u00a9Autor Eneko Aspillaga (IMEDEA).<\/p><\/div>\n

Configurando el puzzle gen\u00e9tico del raor<\/strong><\/h3>\n

El c\u00f3digo gen\u00e9tico completo de una especie, o genoma, es el libro de instrucciones que contiene toda la informaci\u00f3n que, junto con las experiencias vitales y el entorno, determinan c\u00f3mo es y c\u00f3mo se comporta cualquier ser vivo, incluyendo nosotros mismos.<\/p>\n

Conocer todas las piezas que configuran este puzzle gen\u00e9tico es muy complejo. Por ejemplo, han hecho falta casi 20 a\u00f1os para conocer el genoma humano completo. Gracias a los adelantos actuales en t\u00e9cnicas gen\u00f3micas, han aparecido iniciativas como el Earth Biogenome Project (EBP), que tiene como objetivo obtener la informaci\u00f3n gen\u00e9tica de unos dos millones de especies de plantas, animales, hongos y microorganismos. A partir de este proyecto a nivel mundial, naci\u00f3 la Iniciativa Catalana para el Earth Biogenome Project (CBP), impulsada desde la Societat Catalana de Biologia y la Instituci\u00f3 Catalana d\u2019Hist\u00f2ria Natural con el apoyo del Institut d\u2019Estudis Catalans, y que contribuye al cat\u00e1logo mundial obteniendo informaci\u00f3n gen\u00e9tica de especies end\u00e9micas o de inter\u00e9s local.<\/p>\n

Gracias a la financiaci\u00f3n proporcionada por la CBP, el IMEDEA y el Centro Nacional de An\u00e1lisis Gen\u00f3mico (CNAG) han trabajado conjuntamente para conseguir descifrar el c\u00f3digo gen\u00e9tico del raor. A trav\u00e9s de este estudio, liderado por el Equipo de Ensamblaje y Anotaci\u00f3n del Genoma del CNAG y el Laboratorio de Ecolog\u00eda de Peces del IMEDEA, se ha conseguido obtener toda la informaci\u00f3n gen\u00e9tica contenida en los 24 cromosomas que tiene el raor.<\/p>\n

De acuerdo con el responsable del equipo del CNAG, Tyler Alioto<\/strong>: \u201cUtilizando una combinaci\u00f3n de tecnolog\u00edas gen\u00f3micas de \u00faltima generaci\u00f3n, como son las lecturas largas de Oxford Nanopore Technologies, las lecturas cortas de Illumina, Hi-C y la secuenciaci\u00f3n ARN, hemos conseguido un ensamblaje de genoma anotado a escala cromos\u00f3mica para esta especie. Estudios como el actual nos ayudan en CNAG a mejorar los procesos de gen\u00f3mica para continuar ampliando el cat\u00e1logo disponible de genomas de referencia de alta calidad, como recurso para otros estudios gen\u00e9ticos y aplicaciones en el campo de la biodiversidad\u201d.<\/p>\n

\u00bb Art\u00edculo de referencia: <\/strong>Fernando Cruz, J\u00e8ssica G\u00f3mez-Garrido, Marta Gut, Tyler S Alioto, Joan Pons, Josep Al\u00f3s, Margarida Barcelo-Serra, Chromosome-level assembly and annotation of the Xyrichtys novacula (Linnaeus, 1758) genome, DNA Research, 2023;, dsad021, DOI:\u00a0https:\/\/doi.org\/10.1093\/dnares\/dsad021<\/a><\/p>\n

\u00bb M\u00e1s informaci\u00f3n: web del CNAG [+]<\/a><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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