{"id":81794,"date":"2023-01-31T16:26:37","date_gmt":"2023-01-31T15:26:37","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/el-dr-fran-supek-recibe-un-proyecto-erc-consolidator\/"},"modified":"2025-10-13T15:03:54","modified_gmt":"2025-10-13T13:03:54","slug":"el-dr-fran-supek-recibe-un-proyecto-erc-consolidator","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/es\/el-dr-fran-supek-recibe-un-proyecto-erc-consolidator\/","title":{"rendered":"El Dr. Fran Supek recibe un proyecto ERC Consolidator"},"content":{"rendered":"<p><strong>Hoy, el <a href=\"https:\/\/erc.europa.eu\/news-events\/news\/erc-2022-consolidator-grants-results\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">European Research Council (ERC)<\/a> ha anunciado la concesi\u00f3n de los Consolidator Grants a 321 cient\u00edficos y cient\u00edficas de toda Europa, 91 en el \u00e1mbito de las ciencias de la vida. Espa\u00f1a es el tercer pa\u00eds de la Uni\u00f3n Europea en cuanto a ayudas concedidas, 24 en total, 10 de las cuales han sido entregadas a centros de Catalu\u00f1a. Fran Supek, jefe del laboratorio de Genome Data Science del<a href=\"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/es\/empresa\/institut-de-recerca-biomedica-irb-barcelona\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> IRB Barcelona<\/a> en el PCB, ha obtenido una ERC Consolidator Grant de 2 M\u20ac para llevar a cabo el proyecto STRUCTOMATIC, que estudiar\u00e1 unos tipos de mutaciones, llamadas \u2018variantes estructurales\u2019, y su papel en el c\u00e1ncer y otras enfermedades. Este es el segundo proyecto ERC que se concede al Dr. Supek, y el 23\u00ba al IRB Barcelona.<\/strong><\/p>\n<p>Las variantes estructurales son unos tipos de mutaciones poco estudiadas que implican la modificaci\u00f3n de grandes regiones de ADN que pueden cambiar la regulaci\u00f3n de m\u00faltiples genes a la vez. Se sabe que participan en la progresi\u00f3n del\u00a0 c\u00e1ncer en estadios avanzados, como los metast\u00e1ticos, as\u00ed como en otras enfermedades gen\u00e9ticas, y podr\u00edan tener alg\u00fan papel en el envejecimiento.<\/p>\n<p>El equipo de investigadores del proyecto STRUCTOMATIC, dirigidos por el<strong> Dr.<\/strong> <strong>Fran Supek<\/strong>, se centrar\u00e1 en estudiar el papel que estas variantes tienen en diferentes tipos de c\u00e1ncer, incluidos los de pulm\u00f3n, pr\u00f3stata, cabeza y cuello, ovario, es\u00f3fago y c\u00e1ncer de mama triple negativo, as\u00ed como en el sarcoma.<\/p>\n<p>\u00abEste proyecto es una excelente oportunidad para que podamos entender mejor este tipo de mutaciones, muy comunes y poco estudiadas, y c\u00f3mo se relacionan con la evoluci\u00f3n del c\u00e1ncer\u00bb, afirma el\u00a0<strong>Dr. Supek<\/strong>. \u201cEl apoyo del ERC es crucial en la consolidaci\u00f3n de laboratorios como el nuestro, lo cual nos permite centrarnos en cuestiones cient\u00edficas ambiciosas e interesantes y rendir al m\u00e1ximo. La rigurosa evaluaci\u00f3n de las solicitudes de los proyectos hace que el ERC sea un referente para el fomento de la excelencia en la ciencia\u201d, a\u00f1ade. Este a\u00f1o, del total de solicitudes del ERC Consolidator presentadas, el 14,4% han sido exitosas.<\/p>\n<h3><strong>El reto de abordar las variantes estructurales<\/strong><\/h3>\n<p>Las variantes estructurales son modificaciones de grandes fragmentos de ADN. Se pueden clasificar en distintos subtipos, como las inversiones (cuando una secci\u00f3n de ADN se separa y se vuelve a unir en orden inverso), las alteraciones en el n\u00famero de copias (cuando un fragmento espec\u00edfico se duplica o elimina) y las translocaciones que resultan en fusiones de genes (cuando dos genes se reordenan y acabar formando uno nuevo).<\/p>\n<p>El primer f\u00e1rmaco de precisi\u00f3n para el tratamiento del c\u00e1ncer (Imatinib\/Gleevec) se desarroll\u00f3 para atacar un reordenamiento, el denominado \u00abcromosoma de Filadelfia\u00bb, que causa la leucemia miel\u00f3gena cr\u00f3nica a trav\u00e9s de la fusi\u00f3n de genes. Este f\u00e1rmaco mostr\u00f3 una notable capacidad para inhibir el crecimiento de las c\u00e9lulas cancerosas, respetando las sanas, que no tienen esa fusi\u00f3n. Adem\u00e1s del c\u00e1ncer, algunos tipos de variantes estructurales est\u00e1n relacionadas con otros trastornos gen\u00e9ticos, incluida la enfermedad de Huntington, algunas formas de esclerosis lateral amiotr\u00f3fica, la Ataxia de Friedrich y otros trastornos neurol\u00f3gicos y musculares.<\/p>\n<p>Las variantes estructurales son comunes en las c\u00e9lulas cancerosas e impulsan el desarrollo tumoral a trav\u00e9s de sus efectos sobre los genes del c\u00e1ncer. El proyecto STRUCTOMATIC abordar\u00e1 los mecanismos mutacionales que dan lugar a variantes estructurales (como el \u00abestr\u00e9s de replicaci\u00f3n\u00bb, que suele ocurrir en las c\u00e9lulas cancerosas que se dividen r\u00e1pidamente).<\/p>\n<p>En el proyecto se estudiar\u00e1n las regiones del genoma m\u00e1s susceptibles a sufrir este tipo de mutaciones, as\u00ed como la implicaci\u00f3n de dichas alteraciones estructurales en la progresi\u00f3n del c\u00e1ncer.<\/p>\n<p>En concreto, el equipo tiene como objetivo determinar las variantes estructurales que son \u00abconductoras\u00bb del c\u00e1ncer (es decir, que hacen que el c\u00e1ncer crezca, y que pueden ser dianas terap\u00e9uticas) y aquellas que son meras \u00abpasajeras\u00bb, con poco efecto sobre el tumor.<\/p>\n<h3><strong>Lecturas cortas versus lecturas largas<\/strong><\/h3>\n<p>Una de las razones por las que las variantes estructurales se han estudiado poco es que no son f\u00e1ciles de identificar a partir de los datos est\u00e1ndar de secuenciaci\u00f3n del genoma.<\/p>\n<p>La evidencia sugiere que dos tercios de estas alteraciones en el genoma humano pueden pasar desapercibidas. Para superar esta limitaci\u00f3n, el laboratorio de Genome Data Science emplear\u00e1 una nueva t\u00e9cnica de secuenciaci\u00f3n, denominada \u00absecuenciaci\u00f3n de lectura larga\u00bb. La t\u00e9cnica de secuenciaci\u00f3n m\u00e1s com\u00fanmente utilizada, conocida como \u201clectura corta\u201d, funciona mediante la ruptura del ADN del genoma en peque\u00f1os fragmentos y la \u201clectura\u201d simult\u00e1nea de los mismos.<\/p>\n<p>Sin embargo, las lecturas cortas suelen ser ambiguas y no se puede localizar (\u00abmapear\u00bb) con facilidad en la zona correcta del genoma humano, por lo que esta t\u00e9cnica est\u00e1ndar tiene limitaciones con respecto a la detecci\u00f3n de los reordenamientos de ADN.<\/p>\n<p>Considerados como un enfoque de \u00faltima generaci\u00f3n, los m\u00e9todos de lectura larga permiten la secuenciaci\u00f3n de fragmentos largos de ADN de una sola vez, lo que facilita el reconocimiento de las variantes estructurales.<\/p>\n<p>Adem\u00e1s de la secuenciaci\u00f3n del genoma y el an\u00e1lisis computacional, el grupo de investigaci\u00f3n llevar\u00e1 a cabo estudios experimentales y utilizar\u00e1 la edici\u00f3n de genes CRISPR-Cas9 y Cas12a para modificar c\u00e9lulas humanas en cultivo mediante la desactivaci\u00f3n de ciertos genes protectores. Dicha edici\u00f3n en los experimentos provocar\u00e1 un \u00abestr\u00e9s de replicaci\u00f3n\u00bb, como ocurre en los tumores, y generar\u00e1 variantes estructurales en el genoma de estas c\u00e9lulas. Al secuenciar el genoma, los investigadores vincular\u00e1n el tipo de estr\u00e9s de replicaci\u00f3n con varios patrones de mutaciones gen\u00f3micas, lo que contribuir\u00e1 a desentra\u00f1ar los procesos que tienen lugar en el c\u00e1ncer.<\/p>\n<p>Este proyecto ERC Consolidator aportar\u00e1 apoyo al laboratorio durante los pr\u00f3ximos cinco a\u00f1os y permitir\u00e1 la contrataci\u00f3n de 5 profesionales con perfiles que van desde estudiantes de doctorado hasta investigadores posdoctorales y t\u00e9cnicos de laboratorio. Tambi\u00e9n facilitar\u00e1 la colaboraci\u00f3n con investigadores m\u00e9dicos de varios pa\u00edses de Europa, entre ellos Italia, Noruega y Finlandia, as\u00ed como colaboraciones locales en Barcelona, como la del grupo dirigido por la \u00abalumni\u00bb del IRB Barcelona la <strong>Dra. Alexandra Avgustinova<\/strong>, en el Instituto Sant Joan de D\u00e9u de Barcelona. En 2017, el\u00a0<strong>Dr. Supek<\/strong>\u00a0recibi\u00f3 una ERC Starting Grant por su proyecto HYPER-INSIGHT, que est\u00e1 centrado en el papel de una carga extrema de mutaciones som\u00e1ticas en las c\u00e9lulas humanas con procesos de reparaci\u00f3n del ADN deficientes. Este es el 23o proyecto del ERC concedido al IRB Barcelona: Advanced Grants (7), Consolidator Grants (5), Starting Grants (5) y Proof of Concept grants (6).<\/p>\n<p><strong>\u00bb Enlace a la noticia:<a href=\"https:\/\/www.irbbarcelona.org\/es\/news\/institucionales\/el-dr-fran-supek-recibe-un-proyecto-erc-consolidator-para-el-estudio-de-los\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> web del IRB Barcelona [+]<\/a><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Hoy, el European Research Council (ERC) ha anunciado la concesi\u00f3n de los Consolidator Grants a 321 cient\u00edficos y cient\u00edficas de toda Europa, 91 en el \u00e1mbito de las ciencias de&#8230;<\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":81539,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[345],"tags":[],"class_list":["post-81794","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","category-financiacion"],"acf":[],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v27.3 - 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