{"id":37828,"date":"2012-10-31T00:00:00","date_gmt":"2012-10-30T23:00:00","guid":{"rendered":"http:\/\/www.pcb.ub.edu\/\/investigadores-del-cnag-y-crg-avanzan-en-el-analisis-de-datos-del-genoma\/"},"modified":"2020-11-16T16:17:45","modified_gmt":"2020-11-16T15:17:45","slug":"investigadores-del-cnag-y-crg-avanzan-en-el-analisis-de-datos-del-genoma","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/es\/investigadores-del-cnag-y-crg-avanzan-en-el-analisis-de-datos-del-genoma\/","title":{"rendered":"Investigadores del CNAG y CRG avanzan en el an\u00e1lisis de datos del genoma"},"content":{"rendered":"<p>\u00bb<\/p>\n<div class=\"col-sm-6 detall-noticia-imatges\">\n<div class=\"row\">\n<div class=\"item active one-image\">\n\t\t\t\t\t\t<a class=\"icon-search\" href='http:\/\/www.pcb.ub.edu\/\/wp-content\/uploads\/2020\/11\/1351694582259.jpg'><\/a><br \/>\n\t\t\t\t\t\t<img src='http:\/\/www.pcb.ub.edu\/\/wp-content\/uploads\/2020\/11\/1351694582259.jpg' \/>\n\t\t\t\t\t<\/div><\/div><\/div>\n<p>\t\t\tEl aumento exponencial en la capacidad de secuenciaci\u00f3n, ha convertido en esenciales las herramientas para el an\u00e1lisis de datos para poder procesar la gran cantidad de datos biol\u00f3gicos. Este es el punto de partida que llev\u00f3 a algunos investigadores del CRG y CNAG, al dise\u00f1o de un programa inform\u00e1tico que ayuda a encontrar las secuencias, de forma r\u00e1pida y precisa, en el genoma de referencia. Estas herramientas, llamadas \u00abmappers\u00bb, son esenciales para interpretar los datos de los estudios gen\u00f3micos , pues son el primer paso en el an\u00e1lisis de muchos experimentos biol\u00f3gicos. Despu\u00e9s de 5 a\u00f1os de desarrollo, el resultado es el GEM (<i>Genomic Multitool<\/i>) mapper. <\/p>\n<p>El mapper GEM es varias veces m\u00e1s r\u00e1pido que otros programas utilizados en este tipo de investigaciones y ofrece un gran rendimiento, siendo capaz de igualar  acoplando unos 40 millones de secuencias por hora utilizando una CPU de n\u00facleo \u00fanico. Al utilizar algoritmos que garantizan que no se produzcan emparejamientos err\u00f3neos, GEM es mucho m\u00e1s preciso que otros programas similares. Adem\u00e1s, GEM permite ajustar los par\u00e1metros de b\u00fasqueda a los requisitos espec\u00edficos de cada experimento biol\u00f3gico, y ofrece una versatilidad que no se puede lograr con otras herramientas. <\/p>\n<p> Este excelente desempe\u00f1o de GEM es clave para hacer frente a un problema pr\u00e1ctico: el incre\u00edble aumento en la cantidad de datos de secuenciaci\u00f3n. A modo de ejemplo, el CNAG inici\u00f3 sus operaciones en 2010 con un equipamiento de 12 secuenciadores de segunda generaci\u00f3n, que generaban unas 50 gigabases por d\u00eda. Gracias a los recientes avances en la tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n, en la actualidad, s\u00f3lo 2 a\u00f1os y medio despu\u00e9s, el CNAG genera casi 20 veces m\u00e1s  datos con el mismo n\u00famero de m\u00e1quinas de secuenciaci\u00f3n. Sin embargo, habr\u00eda sido imposible aumentar los recursos inform\u00e1ticos de la CNAG al mismo ritmo (y este es un problema com\u00fan para la investigaci\u00f3n biom\u00e9dica en todo el mundo). Por lo tanto, el desarrollo de herramientas de an\u00e1lisis m\u00e1s eficientes como GEM es esencial para mantenerse al d\u00eda con esta creciente tasa de producci\u00f3n. <\/p>\n<p> La investigaci\u00f3n fue financiada por el Ministerio espa\u00f1ol de Educaci\u00f3n y Ciencia (Programa Consolider), por los Institutos Nacionales de la Salud de EE.UU, el  National Human Genome Research Institute, y por la Uni\u00f3n Europea (READNA y programas ESGI). <\/p>\n<p> <a href=\"http:\/\/www.cnag.cat\/\" target=\"_blank\" class=\"email\" rel=\"noopener noreferrer\">M\u00e1s informaci\u00f3n [+]<\/a>     <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>El equipo de cient\u00edficos del proyecto GEM, liderado por Paolo Ribeca del Centro Nacional de An\u00e1lisis Gen\u00f3mico (CNAG) \u2013con sede en el Parc Cient\u00edfic de Barcelona\u2013 y en el que tambi\u00e9n participan cient\u00edficos del Centro de Regulaci\u00f3n Gen\u00f3mica (CRG), han desarrollado una herramienta para la interpretaci\u00f3n de datos gen\u00f3micos mucho m\u00e1s r\u00e1pida y exacta que otras que se utilizan actualmente: el software GEM (<i>Genomic Multitool<\/i>). 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