El investigador del Instituto de Biolog\u00eda Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC) Enrique Mart\u00edn Blanco, que trabaja en el Parc Cient\u00edfic de Barcelona, ha participado en este trabajo en colaboraci\u00f3n con la investigadora de su equipo Flora Llense, as\u00ed como cient\u00edficos de la Universidad de Harvard (Boston, EEUU), el Instituto de Investigaci\u00f3n del C\u00e1ncer, en Londres (Reino Unido) y el Hospital Monte Sinai de Toronto (Canad\u00e1). <\/p>\n
Como explica Mart\u00edn Blanco, las respuestas celulares del organismo (por ejemplo, un proceso de cicatrizaci\u00f3n o de met\u00e1stasis) esconden complejas redes de se\u00f1alizaci\u00f3n celular interconectadas entre s\u00ed. Hasta el momento, los an\u00e1lisis gen\u00e9ticos utilizados por la comunidad cient\u00edfica para desentra\u00f1ar estos procesos no siempre definen la funci\u00f3n de los genes involucrados. <\/p>\n
\u00abAunque los an\u00e1lisis gen\u00e9ticos cl\u00e1sicos han conseguido identificar los genes esenciales implicados en las redes de se\u00f1alizaci\u00f3n, normalmente no proporcionan mucha informaci\u00f3n sobre las relaciones funcionales que existen entre estos componentes\u00bb, explica Mart\u00edn Blanco. El investigador del CSIC lo ejemplifica as\u00ed: \u00abLos an\u00e1lisis gen\u00e9ticos cl\u00e1sicos, por ejemplo, pueden determinar que si se desactiva el gen A, el gen B responde. Sin embargo, no describen por qu\u00e9 B realiza esta respuesta\u00bb. <\/p>\n
El an\u00e1lisis combinatorio descrito en Science<\/i> constituye, seg\u00fan Mart\u00edn Blanco, \u00abun paso m\u00e1s alla\u00bb en el estudio del genoma a trav\u00e9s de la biolog\u00eda de sistemas. Esta disciplina, a diferencia de m\u00e9todos empiricos cl\u00e1sicos, emplea modelos matem\u00e1ticos que describen el comportamiento del objeto en estudio como una red compleja. Su desarrollo, que despunt\u00f3 a principios de este siglo, puede dar lugar a aplicaciones tanto en farmacolog\u00eda como en biomedicina. <\/p>\n
La t\u00e9cnica desarrollada en esta investigaci\u00f3n sigue esta l\u00ednea y ha conseguido identificar de forma r\u00e1pida y directa sistemas de conexiones funcionales que regulan la se\u00f1alizaci\u00f3n celular. En concreto, han definido una red combinatoria de cascadas de se\u00f1alizaci\u00f3n implicadas en la activaci\u00f3n de JNK, una quinasa que ha centrado los trabajos del equipo de Mart\u00edn Blanco y que est\u00e1 relacionada con procesos de cicatrizaci\u00f3n e invasividad celular en ciertos tipos de c\u00e1ncer. <\/p>\n
Para ello, se sirvieron de un biosensor capaz de detectar la actividad de la JNK mediante un cambio crom\u00e1tico (de color). Mediante interferencia a nivel de ARN, analizaron los diferentes cambios de color en la c\u00e9lula en un an\u00e1lisis de 18.000 combinaciones g\u00e9neticas. Despu\u00e9s, combinando los datos, lograron crear un algoritmo matem\u00e1tico que les permiti\u00f3 construir la red de conexiones funcionales controlando la cascada de JNK. <\/p>\n
Como explica el investigador del CSIC, el m\u00e9todo es extrapolable a otros modelos. \u00abS\u00f3lo basta desarrollar el biosensor adecuado\u00bb. Los resultados que ofrece el an\u00e1lisis tienen asimismo un alto valor predictivo, que evitan partir de cero cuando se analicen procesos complejos en los que la JNK sea un elemento clave. <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Un equipo internacional de investigadores ha desarrollado un nuevo sistema de an\u00e1lisis combinatorio que ofrece informaci\u00f3n m\u00e1s completa y r\u00e1pida que los m\u00e9todos de an\u00e1lisis gen\u00e9ticos cl\u00e1sicos. El trabajo, que aparece publicado en el \u00faltimo n\u00famero de la revista Science<\/i>, describe en concreto un an\u00e1lisis combinatorio en c\u00e9lulas de cultivo de la actividad de la prote\u00edna JNK, implicada en procesos de migraci\u00f3n, muerte celular y respuesta a estr\u00e9s (DOI: 10.1126\/science.1158739).<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[9],"tags":[],"class_list":["post-36709","post","type-post","status-publish","format-standard","category-sin-categorizar"],"acf":[],"yoast_head":"\n