{"id":103045,"date":"2025-03-21T14:41:15","date_gmt":"2025-03-21T13:41:15","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/el-irb-barcelona-desarrolla-el-primer-atlas-unicelular-de-transcriptomas-en-levaduras\/"},"modified":"2025-03-21T14:52:26","modified_gmt":"2025-03-21T13:52:26","slug":"el-irb-barcelona-desarrolla-el-primer-atlas-unicelular-de-transcriptomas-en-levaduras","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/es\/el-irb-barcelona-desarrolla-el-primer-atlas-unicelular-de-transcriptomas-en-levaduras\/","title":{"rendered":"El IRB Barcelona desarrolla el primer atlas unicelular de transcriptomas en levaduras"},"content":{"rendered":"<p><strong>Investigadores del <a href=\"https:\/\/www.pcb.ub.edu\/es\/empresa\/institut-de-recerca-biomedica-irb-barcelona\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">IRB Barcelona<\/a>, con sede en el Parque Cient\u00edfico de Barcelona, desarrollan el primer atlas unicelular de transcriptomas en levaduras. El trabajo, publicado en la revista Nature Communications, presenta una biblioteca con \u201cc\u00f3digos de barras\u201d o barcodes de ARN, dise\u00f1ada para rastrear en paralelo el genotipo y el transcriptoma de cada c\u00e9lula en experimentos de secuenciaci\u00f3n masiva. La heterogeneidad celular constituye un fen\u00f3meno biol\u00f3gico: c\u00e9lulas gen\u00e9ticamente id\u00e9nticas responden de manera diferente ante los mismos est\u00edmulos. Esta diversidad tiene implicaciones en contextos m\u00e9dicos relevantes.<\/strong><\/p>\n<p>La heterogeneidad influye directamente en procesos esenciales como el crecimiento, la respuesta al estr\u00e9s y la supervivencia celular. Por ejemplo, en el c\u00e1ncer, algunas c\u00e9lulas tumorales sobreviven a los tratamientos mientras que otras sucumben; o, en infecciones bacterianas, explica c\u00f3mo surge la resistencia a los antibi\u00f3ticos.<\/p>\n<p>Aunque podemos observar y cuantificar estas diferencias, los mecanismos moleculares que generan esta diversidad permanecen en gran parte desconocidos, representando una frontera importante en la biolog\u00eda moderna.<\/p>\n<p>El desarrollo de tecnolog\u00edas de an\u00e1lisis a nivel de c\u00e9lula \u00fanica ha revolucionado nuestra capacidad para estudiar este fen\u00f3meno. La secuenciaci\u00f3n de ARN de c\u00e9lulas individuales ha permitido catalogar la varianza dentro de poblaciones a m\u00faltiples niveles. Sin embargo, para avanzar hacia una comprensi\u00f3n causal, desarrollamos un sistema que combina perturbaciones gen\u00e9ticas y ambientales a escala gen\u00f3mica.<\/p>\n<p>Ahora, <a href=\"https:\/\/www.irbbarcelona.org\/es\/research\/cell-signaling\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">un equipo cient\u00edfico del IRB Barcelona<\/a>, liderado por el <strong>Dr. Francesc Posa<\/strong>s y la <strong>Dra. Laia de Nadal<\/strong>, ha desarrollado una herramienta para analizar de forma masiva la relaci\u00f3n entre los genes y el \u201ccomportamiento\u201d celular, aportando datos esenciales sobre c\u00f3mo la heterogeneidad en la expresi\u00f3n g\u00e9nica influye en procesos como la diferenciaci\u00f3n y el envejecimiento. \u201cGracias a este desarrollo, se ha generado un atlas de la transcripci\u00f3n de una poblaci\u00f3n celular, as\u00ed como de m\u00e1s de 4.000 mutantes, sin precedentes, que revela la heterogeneidad dentro de una poblaci\u00f3n y las consecuencias fenot\u00edpicas de la misma\u201d, explica el<strong> Dr. Posas<\/strong>.<\/p>\n<h3><strong>Una nueva versi\u00f3n de la colecci\u00f3n de <em>knockouts<\/em> en levaduras<\/strong><\/h3>\n<p>Para lograrlo, el equipo ha \u201creconfigurado\u201d la colecci\u00f3n cl\u00e1sica de mutantes de levadura (YKOC, por sus siglas en ingl\u00e9s) para que cada mutante quede identificado de manera \u00fanica. As\u00ed, cuando se analiza el ARN de la poblaci\u00f3n mediante t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n, se puede saber f\u00e1cilmente a qu\u00e9 mutante corresponde cada c\u00e9lula. Gracias a la implementaci\u00f3n de una plataforma de micropocillos, la t\u00e9cnica reduce considerablemente los costos y mejora la eficiencia respecto a los m\u00e9todos tradicionales.<\/p>\n<p>\u201cLa principal motivaci\u00f3n era descubrir c\u00f3mo puede ser que, ante una misma se\u00f1al, algunas c\u00e9lulas activen o no ciertos genes. Esa variabilidad es dif\u00edcil de estudiar en experimentos globales, y necesit\u00e1bamos herramientas de c\u00e9lula \u00fanica\u201d, comenta la <strong>Dra. Mariona Nadal<\/strong>, primera autora del estudio.<\/p>\n<h3><strong>Los estados y la diversidad celular<\/strong><\/h3>\n<p>La herramienta desarrollada ha permitido perfilar m\u00e1s de un mill\u00f3n de c\u00e9lulas de 3.500 mutantes bajo condiciones de control y estr\u00e9s. Los resultados revelan que, aunque la mayor\u00eda de los mutantes comparten un patr\u00f3n de estados celulares \u201cn\u00facleo\u201d o \u201ccore\u201d resistentes a perturbaciones, existe un 10% que se desv\u00eda y se \u201cencalla\u201d en estados espec\u00edficos. Estos estados, relacionados con funciones como el metabolismo del hierro o la respuesta a hipoxia, pueden influir en el comportamiento celular y la capacidad de adaptaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Entre las conclusiones m\u00e1s destacadas del estudio se encuentra la evidencia de que la diversidad transcripcional, incluso en un organismo unicelular como la levadura, est\u00e1 organizada en un continuo de estados celulares. Este hallazgo podr\u00eda tener importantes implicaciones para comprender procesos en organismos m\u00e1s complejos, como el envejecimiento, la resistencia a tratamientos y la respuesta a condiciones ambientales adversas.<\/p>\n<p><strong>\u00bb Art\u00edculo de referencia: <\/strong>A single-cell resolved genotype-phenotype map using genome-wide genetic and environmental perturbations. Mariona Nadal-Ribelles, Carme Sol\u00e9, Anna Diez-Villanueva, Camille Stephan-Otto Attolini, Yaima Matas, Lars Steinmetz, Eulalia de Nadal, and Francesc Posas. Nature Communications (2025) doi:\u00a0<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41467-025-57600-4\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">10.1038\/s41467-025-57600-4<\/a>.<\/p>\n<p><strong>\u00bb Enlace a la noticia: <\/strong><a href=\"https:\/\/www.irbbarcelona.org\/es\/news\/cientificas\/celulas-iguales-respuestas-distintas?utm_campaign=posas-natcomms2-mar25&amp;utm_content=en&amp;utm_medium=social&amp;utm_source=bluesky\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">web de l&#8217;IRB [+]<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Investigadores del IRB Barcelona, con sede en el Parque Cient\u00edfico de Barcelona, desarrollan el primer atlas unicelular de transcriptomas en levaduras. 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