La plataforma de transcriptòmica espacial 3D del Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica (CNAG), amb seu al Parc Científic de la Universitat de Barcelona (PCB-UB), empra una tecnologia única en el món per a l’anàlisi de l’activitat dels gens en el seu context tridimensional, posicionant a Espanya en l’avantguarda de la recerca genòmica internacional. L’equip permetrà estudiar malalties complexes com el càncer. 

Després de la publicació del genoma humà fa ara 25 anys, la carrera de les tecnologies genòmiques no ha parat ni un segon. La revolució més recent va arribar amb les plataformes de genòmica espacial, que permeten estudiar les cèl·lules a través de l’activitat dels seus gens en el seu context natiu directament sobre el teixit. Ara, la incorporació de la primera tecnologia de transcriptòmica espacial 3D, capaç d’analitzar l’expressió gènica preservant l’organització tridimensional del teixit en el Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica (CNAG), ha tornat a transformar l’escenari de les ciències òmiques a Espanya.

El nou equip, el primer instal·lat a Espanya i tercer en tota Europa, desxifrarà com les cèl·lules vetllen pel bon funcionament de l’organisme o contribueixen al desenvolupament de malalties, afegint per primera vegada una capa d’informació fins ara inaccessible: la possibilitat d’observar-les en tres dimensions, en el lloc exacte que ocupen dins de l’òrgan, per a comprendre com aquesta posició condiciona el seu comportament. És precisament aquesta nova tercera dimensió la que aporta una visió molt més pròxima a l’entorn original de les cèl·lules, revelant amb més fidelitat com funciona l’òrgan i avançant cap a un coneixement més precís de la realitat biològica de l’organisme.

Cap a una comprensió més completa de les malalties

El principal objectiu de la plataforma de transcriptòmica espacial 3D, Pyxa d’Stellaromics, és contribuir a un estudi més complet de les malalties complexes, com el càncer, els trastorns del sistema immunitari i les malalties inflamatòries cròniques, entre altres. Gràcies a l’anàlisi de teixits intactes, fins a 20 vegades més gruixuts que els que podien estudiar-se amb les tecnologies de genòmica espacial anteriors, els investigadors podran analitzar una gran varietat de teixits i òrgans de pacients, procedents de tumors primaris, metàstasis o teixit sa. El primer projecte ja està en marxa i es centra en el càncer colorectal, un dels tumors més freqüents a tot el món i també un dels més agressius

“Amb aquesta innovadora tecnologia ens hem posat les ulleres 3D per a veure en primera fila com es desenvolupa el tumor en un context molt pròxim a la realitat. Serem testimonis privilegiats dels mecanismes que hi ha darrere de la progressió de les malalties, veient per primera vegada en tres dimensions processos com l’activació dels gens, la generació dels missatges d’ARN i la traducció d’aquesta informació en proteïnes”, explica la Dra. Anna Pascual Reguant, líder de l’Equip de Genòmica Espacial al CNAG. D’aquesta manera, el nou equip permetrà realitzar estudis de transcriptòmica espacial, que revelen els missatges d’ARN amb les instruccions de les cèl·lules, i de translatòmica espacial, que farà possible construir un mapa de ribosomes per a observar com aquestes instruccions es converteixen en les proteïnes que materialitzen el funcionament de les cèl·lules.

A través de tota aquesta informació clau, els investigadors podran continuar avançant cap a una millor comprensió de l’origen i l’evolució d’un gran nombre de malalties, obrint la porta a detectar nous biomarcadors que contribueixin al disseny de teràpies cada vegada més efectives i personalitzades. D’aquesta manera, Espanya renova el seu posicionament en l’avantguarda de la genòmica espacial internacional amb la incorporació d’aquesta plataforma pionera al CNAG, el centre amb la infraestructura genòmica més gran del país, donant accés a aquestes capacitats d’última generació a la xarxa d’hospitals i centres de recerca del territori. La seva posada en marxa, que ha suposat una inversió de prop de 500.000 euros, ha estat possible gràcies al finançament dels fons europeus Next Generation, a través del Pla de Recuperació, Transformació i Resiliència (PRTR).

» Enllaç a la notícia: web del CNAG [+]