Skip to main content
< Tornar a notícies
Imatge: CNAG-CRG.
 04.06.2020

Científics del CNAG-CRG desenvolupen una nova eina per filmar la dinàmica del genoma

Científics del Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica (CNAG-CRG) –amb seu al Parc Científic de Barcelona i integrat al Centre de Regulació Genòmica (CRG)– han desenvolupat TADdyn, una eina que pot generar pel·lícules de com canvien els genomes amb el temps. La troballa, que es publica a Nature Communications, ajudarà els investigadors de tot el món a aprendre molt més sobre la relació directa entre estructura i funció en el genoma.

 

La manera en què els cromosomes ocupen un espai tridimensional és crucial per a regular la funció del genoma i els processos essencials per a la vida, com la replicació de l’ADN, la transcripció i la reparació del mal de l’ADN.

Als darrers anys, els avanços tecnològics han revelat molt sobre com s’organitzen els genomes, millorant la nostra comprensió de com s’expressen els gens i proporcionant noves idees per al desenvolupament cel·lular i la malaltia.

No obstant això, gran part d’aquest coneixement es basa en imatges estàtiques de genomes, la qual cosa proporciona una visió limitada d’un entorn altament dinàmic.

Ara, científics del CNAG i el CRG han desenvolupat TADdyn, una eina que pot generar pel·lícules de com canvien els genomes amb el temps. La troballa ha estat publicada en Nature Communications.

“Ara podem crear simulacions que reflecteixin els esdeveniments dinàmics reals que ocorren dins del nucli el més a prop possible. No hi ha altres tècniques experimentals disponibles avui dia que puguin fer aquest tipus d’observacions amb aquesta resolució ”, explica Marc A. Marti-Renom, investigador del Centre Nacional d’Anàlisi Genómico i el Centre de Regulació Genòmica. “TADdyn ajudarà els investigadors de tot el món a aprendre molt més sobre la relació directa entre estructura i funció en el genoma”.

Els investigadors van provar la funció de TADdyn en els glòbuls blancs, estudiant els canvis en 21 àrees diferents en el genoma del ratolí. Les pel·lícules van mostrar que l’activació de gens es correlaciona amb l’aparició d’estructures “en forma de gàbia” enriquides amb cromatina activa, que els investigadors diuen centres de potenciadors 3D.

Els autors conclouen que aquests centres potenciadors 3D de cromatina oberta i activa poden constituir una característica general per a desencadenar i mantenir la transcripció gènica.

► Article de referència: Di Stefano M, Stadhouders R, Farabella I, et al. “Transcriptional activation during cell reprogramming correlates with the formation of 3D open chromatin hubs“. Nat Commun. 2020;11(1):2564. Published 2020 May 22. doi:10.1038/s41467-020-16396-1

► Més informació: web del CNAG [+]