La actividad de investigación e innovación del CERETOX se dirige básicamente a los siguientes sectores :

• Industria farmacéutica
• Industria alimentaria
• Industria cosmética
• Industria de material sanitario
• Industria química/biocidas
• Administraciones públicas implicadas en la gestión medioambiental (colaboración en líneas de investigación de ámbito nacional y europeo).
  

• Toxicología experimental
• Ecotoxicología
• Técnicas alternativas
• Analítica de contaminantes en matrices ambientales
• Toxicología y seguridad alimentaria
• Evaluación del riesgo para el Medio Ambiente y para la Salud Pública